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Research Data Open Access Das Marburger Urkundenrepositorium. Eine exemplarische Analyse der Urkunden.(Philipps-Universität Marburg) Löhden, Eike MartinThis dataset mainly contains a Jupyter Notebook which provides examples for analyzing the content of the "Marburger Urkundenrepositorium". The following analysis were made: general information about the repository (How many charters exist? From which collections do they come from?); Where are the physical representation of the charters currently stored (a list of the most common archives)? Are there geographical information connected to the charters? What do we know about the persons connected to the charters? And from which years do we have charters in the repository?
Additionally to the jupyter notebook you can find the text file kleio-example_11480.txt serving as an example for a record of the old kleio database, the document requirements.txt file listing the python requirements necessary for running the jupyter notebook and a README.md providing information about running the notebook. There are also two html files (cao-charters_map.html and lba-charters_map.html) attached, which includes geographic visualizations of the charter's origins.Research Data Open Access Image data(Philipps-Universität Marburg) Schikora, Juliane; Dort, Aaron; Nickel, Antonia; Bergert, Jasmin; Schayan-Araghi, Stella Y.; Banerjee, Pratiti; Wolf, Hannah N.; May-Simera, Helen; Pauly, DianaThis subset of the repository contains the image data of the study in zip folders. This includes several replicates of the recorded 16-bit stacks as tif-files of the immunostainings that can be opened using Fiji. It further contains summary images as jpg-files used for image analysis. And it includes Fiji macros used for generation of merged and single channel stacks (Generation_summary_images.ijm), measurement of nuclei area in ARPE-19 cells (Image_analysis_ARPE-19_NA.ijm), nuclei area in iPSC-RPE cells (Image_analysis_iPSC-RPE_NA.ijm), measurement of cell area (Image_analysis_CA.ijm), and measurement of GT335 ciliary area (Image_analysis_GT335-A.ijm).Research Data Open Access Synthetic Meteosat First Generation MVIRI Visible Band Images (Level 1.5)(Philipps-Universität Marburg) Jung, Ivo; Gaurav, Sheetabh; Bendix, JörgThe data comprises synthetic and harmonized Meteosat First Generation (MFG) MVIRI VIS reflectance Image data from 2006 - 2020. The dataset was created with the intent to extent the existing MFG MVIRI VIS image time series (https://navigator.eumetsat.int/product/EO:EUM:DAT:0080) for long-term climate research. The temporal resolution of the data is 30 minutes per image. Each image covers the WMO VI region up to 62°N. The images are stored as .nc files with reflectance values and geographic and temporal information. Due to the size of the dataset, it is compressed into annual archives. The dataset was created using a trained Random Forest Regressor Model and Meteosat Second Generation VIS channel data (https://data.eumetsat.int/product/EO:EUM:DAT:MSG:HRSEVIRI?query=SEVIRI&s=extended#). No data was created for pixels with Solar-Zenith Angles above 80° due to parallax effects and atmospheric distortion. Additional metadata can be found in the readme file. The data can be used like MFG MvIRI VIS image data i.e. using programming languages like python. The scripts for preprocessing, model training and synthesizing can be found at https://gitlab.uni-marburg.de/fb19/ag-bendix/harmonizing_synthesizing_mfg_vis.Research Data Open Access Western blot data(Philipps-Universität Marburg) Dort, Aaron; Pauly, Diana; Nickel, Antonia; Bergert, Jasmin; Schayan-Araghi, Stella Y.; Banerjee, Pratiti; Wolf, Hannah N.; May-Simera, Helen; Schikora, JulianeThis subset of the repository contains the Western blot data of the study. The original data comes from mscn-files that were opened using Image Lab which is not in an open free format. Therefore the membrane images were exported as tif-files and the associated metadata was exported as a xml file. The subset contains several replicates of the different experiments and specificity controls conducted with purified proteins, and cell culture media. Furthermore, it contains the Western blot conducted after immune precipitation of cell lysates.Research Data Open Access Diversity in Hessian geography textbooks(Philipps-Universität Marburg) Dörfel, LeoniDie Daten stammen aus einer Schulbuchanalyse, die die Darstellung von Diversität in 11 lizenzierten Geographieschulbüchern Hessens (Stand: 1. August 2022) untersuchte. Der Fokus lag auf 13 theoriebasierten Diversitätsdimensionen, die zunächst deduktiv abgeleitet und anschließend induktiv angepasst wurden. Die qualitative Inhaltsanalyse wurde systematisch anhand eines entwickelten Kodierleitfadens durchgeführt, der auf theoriebasierten Kategorien und detaillierten Kodierregeln basiert (siehe "Kodierleitfaden-Schulbuchanalyse"). Es wurden ausschließlich die Autor*innentexte analysiert, wobei als Kodiereinheit sinngebende Textabschnitte (Paragraphen und Subparagraphen) definiert wurden. Insgesamt wurden 4689 Kodiereinheiten identifiziert, die entweder keine Kategorie, eine oder Kombinationen der Diversitätsdimensionen enthielten. Die Intercoder-Reliabilität war mit 0,83 für Datensatz 1 und 0,80 für Datensatz 2 zufriedenstellend. Datensätze: Datensatz 1: Dieser enthält die Ergebnisse der Kodierung aller Diversitätsdimensionen über alle Schulbücher hinweg, wobei die folgenden Auswertungen durchgeführt wurden: (a) absolute und relative Häufigkeiten aller 13 Dimensionen, zusammengefasst und einsehbar für die einzelnen Schulbücher; (b) Auswertung internaler und externaler Dimensionen; (c) Auswertung nach Klassifikationen der Häufigkeiten in Jahrgangsstufen (Unter-, Mittel- und Oberstufe); und (d) Auswertung der Häufigkeiten nach Themenfeldern. Dazu wurden aus den Schulbüchern acht thematische Felder kategorisiert, die eine Analyse der Dimensionen in den Themenfeldern ermöglichten. Datensatz 2: Dieser umfasst die Kodierungen zu Diversitätsdimensionen, die in spezifischen Raumbezügen (z. B. Länder, Regionen, Städte, Kontinente) dargestellt werden. Diese Daten wurden nach Häufigkeiten der Nennungen in drei Kategorien analysiert: (a) Dimensionen in Zusammenhang zu spezifisch benannten Kontinenten, (b) Dimensionen in Zusammenhang zu spezifisch benannten Ländern und (c) Aufsummierung aller Kodierungen in Zusammenhang zu Großregionen, Städten, Ländern für die sechs Kontinente Europa, Asien, Nord- und Südamerika, Afrika und Ozeanien. Die Antarktis wurde wegen fehlender Nennungen ausgeschlossen. Es war möglich, dass Kodierungen einer Kodiereinheit für mehrere Räume kodiert wurden, jedoch maximal einmal für denselben Raum. Für die Auswertung (c) bedeutet das, dass trotz einer möglichen Kodierung mehrerer Länder desselben Kontinents nur einmal kodiert wurde.Research Data Open Access Kohlenstoffdioxidmesswerte der Ketzerbach in Marburg an der Lahn und des Referenzgebiets in Marburg-Schröck(Philipps-Universtität Marburg) Nieke Fläschner; Dr. Kerstin Bach; Dr. Jürgen KlugeDieser Datensatz enthält Messwerte zur Luftqualität an 2 Standorten in Marburg. Die Daten wurden im Zeitraum August und September 2024 erhoben mittels dem mobilen Messgerät der Firma Rotronic CP 11. Gemessen wurden Luftfeuchtigkeit, Temperatur und CO₂-Konzentration. Die Daten werden im CSV-Format zur Verfügung gestellt (Feldtrenner: ";"). Die ersten 6 Zeilen enthalten Informationen zum Messgerät. Das Messgerät wurde daher immer in die Mitte der Ketzerbach 50 cm über dem Boden angebracht. Der Abstand zur Straße betrug auf beiden Seiten 1,20 m und zu den Gebäuden links 10,52 m und rechts 7,23 m. In Marburg- Schröck wurde das Messgerät auf 150 cm Höhe angebracht und nach nordöstlicher Richtung ausgerichtet und stand am Fahrbahnrand, 8 Meter von den Häusern entfernt. Das Messintervall betrug 1 Minute.Research Data Open Access Video data(Philipps-Universität Marburg) Schikora, Juliane; Dort, Aaron; Nickel, Antonia; Bergert, Jasmin; Schayan-Araghi, Stella Y.; Banerjee, Pratiti; Wolf, Hannah N.; May-Simera, Helen; Pauly, DianaThis subset of the repository contains the video data of the study. This includes mp4-files that show stained proteins in an apical to basal direction. It further contains the Fiji macro used for generating mp4-files from tif-files that can be found in the image data subset of this collection.Research Data Open Access Vorschlag für ein gemeinsames Metadatenschema für die Sammlungen der Philipps-Universität Marburg(Philipps-Universität Marburg, Stabsstelle Forschungsdatenmanagement) Maul, AlexanderDie Philipps-Universität Marburg entwickelt derzeit ein Konzept zur digitalen Präsentation ihrer wissenschaftlichen Sammlungen. Hierbei verfolgt ein im Rahmen der Landesinitiative HeFDI vom Hessischen Ministerium für Wissenschaft und Forschung, Kunst und Kultur (HMWK) gefördertes Projekt den Auftrag, Datenbankmanagementsysteme zur Integration wissenschaftlicher Sammlungen anzu-passen. Neben der Konzeptionierung und Implementierung einer langfristig trag-fähigen Datenbank hat das Projekt die Pilotierung der Sammlungsdigitalisierung an der Philipps-Universität zur Aufgabe. Der Projektfortschritt wird über die Projektseite (https://uni-marburg.de/DFpFGf) dokumentiert. Der Datensatz enthält einen Vorschlag für ein gemeinsames Metadatenschema für die Sammlungen der Philipps-Universität. Hierbei unterteilt sich das Modell in folgende Bereiche: 1. Automatische Administrationsfelder 2. Minimalerfassung 3. Empfohlene Erfassungsfelder 4. Zusätzliche Felder für Objekte aus sensiblen Kontexten 5. Akzession, Bilanzierung, Deakzession 6. Interne Dokumentation und Sammlungsmanagement 7. Individuelle sach- und fachspezifische Metadatenfelder Der Vorschlag gibt den Bearbeitungsstand im November 2024 wieder. Er ist ausdrücklich als Vorschlag konzipiert, auf dessen Grundlage weitere Absprachen erfolgen sollten.Research Data Open Access Analytical data(Philipps-Universität Marburg) Schikora, Juliane; Dort, Aaron; Nickel, Antonia; Bergert, Jasmin; Schayan-Araghi, Stella Y.; Banerjee, Pratiti; Wolf, Hannah N.; May-Simera, Helen; Pauly, DianaThis subset of the repository contains the analytical data generated in the study. This includes data of the transcript expression analysis, multiplex immunoassays, enzyme-linked immunosorbent assays, image analyses, and measurement of transepithelial resistance. Furthermore, the validation of the multiplex immunoassays with purified proteins and sera is included.Research Data Open Access In vitro-in situ comparison study - Data set(Philipps-Universität Marburg) Jablonski-Momeni, AnahitaThis data set presents the data which were analysed for the following publication: A comparison between in vitro and randomized in situ models for remineralization of artificial enamel lesions Jablonski-Momeni A, Lentz J, Jablonski B, Kiesow A, Morawietz M. Sci Rep. 2024 Oct 25;14(1):25295. doi: 10.1038/s41598-024-76387-w. Abstract: The randomized study aimed to evaluate the comparability of in situ (iS) and in vitro (iV) study protocols regarding remineralization of artificial enamel lesions. Two toothpastes (group A: 1450 ppm sodium fluoride, group B: placebo 0 ppm F-), were investigated. IV, a pH-cycling model with toothpaste slurry treatment was applied for 10d. IS, remineralization was performed in 9 participants wearing splints with embedded enamel samples for 10 and 21d, randomly allocated to groups A and B. Samples were scanned by X-ray micro-computed tomography (μCT) and grayscale value line profiles corresponding to mineral density (rel.ΔZ) were analyzed. T-Test for dependent and independent data and analysis of variance (ANOVA) were used for further analyses (α = 0.05). Rel.ΔZ of fluoride treated samples (A) were iV = 40.2%, iS 10d = 11.5% and iS 21d = 46.1% (p > 0.05). Rel.ΔZ of placebo treated samples (B) were: iV = − 6.2%, iS 10d = 25.2% and iS 21d = 11.0% (p > 0.05). Remineralization potential of both toothpastes was significantly different regarding iV (p < 0.001) and iS after 21d (p = 0.034), while in case of iS 10d no significant difference was detected (p = 0.4). Despite different study protocols the μCT results after remineralization were comparable between iV and iS. The results suggest that selected studies can be carried out in faster, simplified iV studies using pH-cycling instead of iS studies.